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Peptides ; 106: 37-44, 2018 08.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-29933027

RESUMO

A previously undescribed six residues long peptide His-Arg-Phe-Leu-Arg-His was identified and purified from the skin secretion of the amphibian Phyllomedusa centralis. A synthetic analogue carboxyamidated HRFLRH-NH2 showed structural changes induced by CO2 and metal ions in aqueous solution when analyzed by NMR. The present work reports NMR structures for the carboxyamidated hexapeptide in the presence CO2, Zn2+ and Cd2+, suggesting possible affinity regions on the polypeptide chain for each ligand. The NMR structures were optimized by DFT to identify probable biding sites of these species in the polypeptide structure. To our best knowledge, this is the first time that a putative CO2 binding site is described on a peptide structure obtained in aqueous conditions, at room temperature.


Assuntos
Proteínas de Anfíbios/química , Anuros/fisiologia , Dióxido de Carbono/química , Cátions Bivalentes/química , Oligopeptídeos/química , Pele/metabolismo , Proteínas de Anfíbios/isolamento & purificação , Animais , Sítios de Ligação , Cádmio/química , Ligantes , Oligopeptídeos/isolamento & purificação , Conformação Proteica , Zinco/química
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